MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Francisella novicida U112 chromosome

Total Repeats: 41014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008601	A	8	8	168	175	100 %	0 %	0 %	0 %	118496616
2	NC_008601	A	9	9	177	185	100 %	0 %	0 %	0 %	118496616
3	NC_008601	A	6	6	280	285	100 %	0 %	0 %	0 %	118496616
4	NC_008601	CAA	2	6	320	325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118496616
5	NC_008601	ATT	2	6	352	357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496616
6	NC_008601	TAA	2	6	366	371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496616
7	NC_008601	A	6	6	370	375	100 %	0 %	0 %	0 %	118496616
8	NC_008601	A	7	7	385	391	100 %	0 %	0 %	0 %	118496616
9	NC_008601	T	7	7	426	432	0 %	100 %	0 %	0 %	118496616
10	NC_008601	CAA	2	6	437	442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118496616
11	NC_008601	AGA	2	6	465	470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118496616
12	NC_008601	AGT	2	6	477	482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496616
13	NC_008601	AAG	2	6	502	507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118496616
14	NC_008601	TCA	2	6	529	534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496616
15	NC_008601	AGA	2	6	579	584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118496616
16	NC_008601	TGT	2	6	639	644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118496616
17	NC_008601	AGC	3	9	669	677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118496616
18	NC_008601	TGG	2	6	729	734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118496616
19	NC_008601	GCAA	2	8	762	769	50 %	0 %	25 %	25 %	118496616
20	NC_008601	ATT	2	6	808	813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496616
21	NC_008601	TTA	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496616
22	NC_008601	CAAGAT	2	12	865	876	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118496616
23	NC_008601	TGAT	2	8	914	921	25 %	50 %	25 %	0 %	118496616
24	NC_008601	GAA	2	6	1051	1056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118496616
25	NC_008601	A	6	6	1138	1143	100 %	0 %	0 %	0 %	118496616
26	NC_008601	CAG	2	6	1178	1183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118496616
27	NC_008601	GTAC	2	8	1201	1208	25 %	25 %	25 %	25 %	118496616
28	NC_008601	AG	3	6	1216	1221	50 %	0 %	50 %	0 %	118496616
29	NC_008601	TAC	2	6	1248	1253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496616
30	NC_008601	CTA	2	6	1277	1282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496616
31	NC_008601	GCTT	2	8	1297	1304	0 %	50 %	25 %	25 %	118496616
32	NC_008601	AAGAA	2	10	1325	1334	80 %	0 %	20 %	0 %	118496616
33	NC_008601	ATA	2	6	1346	1351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496616
34	NC_008601	GTT	2	6	1360	1365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118496616
35	NC_008601	AAG	2	6	1410	1415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118496616
36	NC_008601	TGG	2	6	1503	1508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118496616
37	NC_008601	ATGC	2	8	1528	1535	25 %	25 %	25 %	25 %	118496616
38	NC_008601	GAT	2	6	1582	1587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496616
39	NC_008601	TAAA	2	8	1618	1625	75 %	25 %	0 %	0 %	118496616
40	NC_008601	A	6	6	1652	1657	100 %	0 %	0 %	0 %	118496617
41	NC_008601	TAT	2	6	1742	1747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496617
42	NC_008601	ATA	3	9	1769	1777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496617
43	NC_008601	AGTT	2	8	1830	1837	25 %	50 %	25 %	0 %	118496617
44	NC_008601	TGAA	2	8	1898	1905	50 %	25 %	25 %	0 %	118496617
45	NC_008601	TAA	2	6	1956	1961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496617
46	NC_008601	AGCA	2	8	2027	2034	50 %	0 %	25 %	25 %	118496617
47	NC_008601	CAA	2	6	2050	2055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118496617
48	NC_008601	TCA	2	6	2061	2066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496617
49	NC_008601	TAT	2	6	2067	2072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496617
50	NC_008601	ATG	2	6	2099	2104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496617
51	NC_008601	CTA	2	6	2152	2157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496617
52	NC_008601	A	7	7	2250	2256	100 %	0 %	0 %	0 %	118496617
53	NC_008601	AGA	2	6	2292	2297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118496617
54	NC_008601	ATA	2	6	2414	2419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496617
55	NC_008601	ATT	2	6	2460	2465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496617
56	NC_008601	AT	3	6	2513	2518	50 %	50 %	0 %	0 %	118496617
57	NC_008601	TAA	2	6	2544	2549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496617
58	NC_008601	CAT	2	6	2640	2645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496617
59	NC_008601	GAA	2	6	2659	2664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118496617
60	NC_008601	TCTA	2	8	2671	2678	25 %	50 %	0 %	25 %	118496617
61	NC_008601	ATA	2	6	2723	2728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496617
62	NC_008601	GTTT	2	8	2729	2736	0 %	75 %	25 %	0 %	118496617
63	NC_008601	ATT	2	6	2737	2742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496617
64	NC_008601	GAAT	2	8	2805	2812	50 %	25 %	25 %	0 %	118496618
65	NC_008601	A	7	7	2824	2830	100 %	0 %	0 %	0 %	118496618
66	NC_008601	TA	3	6	2848	2853	50 %	50 %	0 %	0 %	118496618
67	NC_008601	AGT	3	9	2878	2886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496618
68	NC_008601	TAA	2	6	2890	2895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496618
69	NC_008601	TATTTC	2	12	2964	2975	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	118496618
70	NC_008601	CAC	2	6	3024	3029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118496618
71	NC_008601	A	6	6	3045	3050	100 %	0 %	0 %	0 %	118496618
72	NC_008601	TGA	2	6	3068	3073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496618
73	NC_008601	T	6	6	3074	3079	0 %	100 %	0 %	0 %	118496618
74	NC_008601	ATA	2	6	3080	3085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496618
75	NC_008601	T	6	6	3142	3147	0 %	100 %	0 %	0 %	118496618
76	NC_008601	ACC	2	6	3148	3153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118496618
77	NC_008601	AT	3	6	3167	3172	50 %	50 %	0 %	0 %	118496618
78	NC_008601	GAA	2	6	3185	3190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118496618
79	NC_008601	TAT	2	6	3202	3207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496618
80	NC_008601	AAT	2	6	3252	3257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496618
81	NC_008601	AT	3	6	3275	3280	50 %	50 %	0 %	0 %	118496618
82	NC_008601	ATG	2	6	3312	3317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496618
83	NC_008601	AGAA	2	8	3320	3327	75 %	0 %	25 %	0 %	118496618
84	NC_008601	TAA	2	6	3330	3335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496618
85	NC_008601	ATT	2	6	3340	3345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496618
86	NC_008601	T	7	7	3391	3397	0 %	100 %	0 %	0 %	118496618
87	NC_008601	TGA	2	6	3427	3432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496618
88	NC_008601	AT	3	6	3443	3448	50 %	50 %	0 %	0 %	118496618
89	NC_008601	AAT	2	6	3460	3465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496618
90	NC_008601	ATT	2	6	3514	3519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496618
91	NC_008601	TAA	2	6	3532	3537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496618
92	NC_008601	A	7	7	3571	3577	100 %	0 %	0 %	0 %	118496618
93	NC_008601	GAA	2	6	3578	3583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118496618
94	NC_008601	TTA	2	6	3620	3625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496618
95	NC_008601	GCT	2	6	3647	3652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118496618
96	NC_008601	CCA	2	6	3653	3658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118496618
97	NC_008601	CCA	2	6	3665	3670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118496618
98	NC_008601	AT	3	6	3718	3723	50 %	50 %	0 %	0 %	118496618
99	NC_008601	TAA	2	6	3781	3786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496618
100	NC_008601	AAT	2	6	3794	3799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496618
101	NC_008601	T	8	8	3801	3808	0 %	100 %	0 %	0 %	118496618
102	NC_008601	AGA	2	6	3837	3842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118496618
103	NC_008601	TAA	2	6	3858	3863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496618
104	NC_008601	A	7	7	3862	3868	100 %	0 %	0 %	0 %	118496618
105	NC_008601	TAAAG	2	10	3871	3880	60 %	20 %	20 %	0 %	118496618
106	NC_008601	GTAT	2	8	3886	3893	25 %	50 %	25 %	0 %	118496618
107	NC_008601	TTG	2	6	3916	3921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118496618
108	NC_008601	GCA	2	6	3950	3955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118496618
109	NC_008601	CATAC	2	10	3958	3967	40 %	20 %	0 %	40 %	118496618
110	NC_008601	AT	3	6	4014	4019	50 %	50 %	0 %	0 %	118496618
111	NC_008601	T	6	6	4019	4024	0 %	100 %	0 %	0 %	118496618
112	NC_008601	A	7	7	4255	4261	100 %	0 %	0 %	0 %	118496619
113	NC_008601	TTA	2	6	4330	4335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496619
114	NC_008601	AGC	2	6	4345	4350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118496619
115	NC_008601	AGC	2	6	4354	4359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118496619
116	NC_008601	TAT	2	6	4413	4418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496619
117	NC_008601	CAA	2	6	4440	4445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118496619
118	NC_008601	ATT	2	6	4450	4455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496619
119	NC_008601	CA	3	6	4561	4566	50 %	0 %	0 %	50 %	118496619
120	NC_008601	AT	4	8	4567	4574	50 %	50 %	0 %	0 %	118496619
121	NC_008601	TA	4	8	4579	4586	50 %	50 %	0 %	0 %	118496619
122	NC_008601	ACTT	2	8	4621	4628	25 %	50 %	0 %	25 %	118496619
123	NC_008601	TAA	2	6	4674	4679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496619
124	NC_008601	ATA	2	6	4763	4768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496619
125	NC_008601	AGC	2	6	4774	4779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118496619
126	NC_008601	TTCA	2	8	4782	4789	25 %	50 %	0 %	25 %	118496619
127	NC_008601	TGG	2	6	4798	4803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118496619
128	NC_008601	T	6	6	4880	4885	0 %	100 %	0 %	0 %	118496619
129	NC_008601	CAG	2	6	4911	4916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118496619
130	NC_008601	TTAG	2	8	4952	4959	25 %	50 %	25 %	0 %	118496619
131	NC_008601	TA	3	6	4981	4986	50 %	50 %	0 %	0 %	118496619
132	NC_008601	TAC	2	6	4992	4997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496619
133	NC_008601	TGG	2	6	5011	5016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118496619
134	NC_008601	CAGGTA	2	12	5148	5159	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118496619
135	NC_008601	TTAT	2	8	5160	5167	25 %	75 %	0 %	0 %	118496619
136	NC_008601	CTA	2	6	5175	5180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496619
137	NC_008601	AAATG	2	10	5191	5200	60 %	20 %	20 %	0 %	118496619
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397	NC_008601	AAAGA	2	10	17823	17832	80 %	0 %	20 %	0 %	118496634
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